Le Isole Tremiti immerse nell'adriatico a 12 miglia dalla costa garganica sono conosciute per la loro bellezza e per il fatto di essere uno dei tre parchi marini pugliesi. Ad eccezione di Pianosa, piccola isoletta più vicina alle acque Iugoslave che a quelle Italiane e inaccessibile tanto alla balneazione quanto alla navigazione le tre isole Caprara San Nicola e San Domino sono calassificate come zona C e B. Nella zona B è concessa la navigazione, la balneazione ed in parte la pesca (solo con la lenza) nella zona C è concessa anche la pesca sportiva. Sottoposte al moto ondoso sono state modellate in un sugestivo susseguirsi di ripide scogliere, insenature rocciose, grotte, archi naturali e tranquille calette, in un armonico alternarsi che si ripete nelle parti sommerse, dove a fondali rocciosi lentamente degradanti, si alternano falesie che si inabissano vertiginosamente, bassifondi sabbiosi, fondi ciotolosi. Ad una tale varietà di tipologie morfologiche consegue una notevole varietà di popolamenti animali e vegetali. I fondali delle isole costituiscono, pertanto, un'area di importantissimo valore naturalistico. Al fine di conservare tutelare e valorizzare questo patrimonio naturale è stata istituita la Riserva Naturale Marina "Isole Tremiti". La straordinaria limpidezza delle acque che circondano le isole, permette, con estrema facilità, di osservare già a pochi metri di profondità spugne coloratissime che incrostano le rocce; Anellidi con i loro eleganti e variopinti ventagli tentacolari; ricci che la erodono scavando delle tane, coloratissime stelle marine, il tucano dalla caratteristica colorazione rosso- arancione. Numerose alghe verdi, quali i caratteristici ombrellini di acetabularia, la fogliacea Udotea petiolata e l'articolata a dischi appiattiti Helimeda tuna, Alghe brune come Padina pavonia, Dictyopteris polypodiedes e Dyctiota dichtoma. Importantissima poi è la presenza della poseidonia oceanica, vera e propria pianta con fiori fusto e frutti. Scendendo più in profondità lungo le falesie rocciose è possibile incontrare rigogliosi e variopinti ventagli di gorgonie. Le pareti rocciose presenti in prossimità di punta Secca di Caprara, offre ai subacquei una visione di straordinaria bellezza. Paramuricea clavata con le sue colonie rosse e gialle; Eunicella cavolinii dalle gracili colonie giallastre.
In queste splendide chiazze di colore giallo e rosso è facile trovare polipi solitari di un bel colore giallo. Numerose e vivacemente colorate anche i Poliferi con Axinella cannabina, Axinella polypoides. Tra i naturali ventagli delle gorgonie nuotano numerosisseme castagnole mentre negli anfratti è facilissimo incontrare delle cernie e murene, gronchi e aragoste, abbondanti anche i saraghi fasciati e dentici nonché nei periodi di passo ricciole.
Gli ambienti di grotta presenti nell'arcipelago dele tremiti sono di notevole bellezza. Tra questi, la grotta delle viole, la Grotta del bue marino e la grotta della Rondinelle, risultano essere le più interessanti per la comunità.